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小球藻是一種優質的綠色營養源食品，其主要營養成分甚至優于某些主要食品，具有高蛋白、低脂肪、低糖、低熱量以及維生素、礦物質元素含量豐富的優點，并且具有某些特殊保健功能。因此，小球藻是食品添加劑以及保健食品等的優質健康食品源。

蛋白質及氨基酸

小球藻蛋白質含量很高，但營養成分會因藻種品系、培養方式以及培養基的不同而有所差異。小球藻蛋白質含量頗豐，氨基酸種類齊全并且比例接近標準模式，完全能滿足人、動物的生長所需，是優良的單細胞蛋白源，可以作為營養強化劑應用于食品產業，應用時應注意與蛋氨酸、胱氨酸以及蘇氨酸的配合，通過氨基酸的互補進一步提高其營養價值。

多糖

多糖是一種廣泛存在于動物細胞膜、植物及微生物細胞壁的生物大分子物質，是生命組成的 4 大基本物質之一。小球藻多糖具有活性的功能。小球藻這一營養成分的特殊功能使其在保健領域得到應用。