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胃蛋白酶（英文名稱：Pepsin）是一種消化性蛋白酶，由中的胃粘膜主細胞（gastric chief cell）所分泌，功能是將食物中的蛋白質分解為小的肽片段。主細胞分泌的是胃蛋白酶原，胃蛋白酶原經或者胃蛋白酶刺激后形成胃蛋白酶，胃蛋白酶不是由細胞直接生成的。

胃蛋白酶測定可用于鑒別神經性低酸癥，當過少或缺乏時，前者胃蛋白酶的含量有時正常而后者鹽酸與胃蛋白酶同時缺乏。一般認為胃性低酸癥是由于胃粘膜的器質性變化所致，特別是對于、無酸癥、無胃蛋白酶分泌是診斷上的重要所見。、慢性、慢性十二脂等胃蛋白酶的分泌常減少。一般基礎分泌高的，如等，胃蛋白酶活性增高。1836年，（Theodor Schwann）在對消化過程進行的研究中，發現了一種能夠參與消化作用的，并將其命名為胃蛋白酶。胃蛋白酶也是個從動物身上獲得的酶。